O CEPF busca selecionar Parceiros Implementadores previamente identificados, bem posicionados para responder a crises de conservação em países parceiros elegíveis para receber ajuda ao desenvolvimento da União Europeia. Organizações não governamentais e outras organizações da sociedade civil com experiência significativa em conservação da biodiversidade e presença estabelecida em um ou mais países beneficiários da ajuda ao desenvolvimento da UE podem se candidatar.