Apoiar projetos de pesquisa que visem contribuir significativamente para o desenvolvimento científico, tecnológico e a inovação do país, nas seguintes áreas prioritárias: Recuperação e monitoramento de ecossistemas amazônicos; Biotecnologia; Geração de energia renovável; Sistemas alimentares sustentáveis; Adaptação e mitigação à mudança climática; Educação, cultura, povos e saberes tradicionais; Gestão de recursos hídricos; Saúde da população Amazônica; Tecnologias sociais; Soluções de inteligência artificial aplicada aos desafios da Região Amazônica; Integração regional Amazônica; Cadeias produtivas da sociobiodiversidade Amazônica; Mineração na Amazônia.